ある中学校で、理科室に入った二人の生徒の内一人が消えた。 これがその学校に伝わる、生徒が消えた理科室の怪談である。 その中学校に通う幼馴染の二人、瀬川真美と岩井陽一が、怪談の謎に挑む。 怪談の正体は幽霊か神隠しか。手がかりは怪談の中にあった。