私立　六芒学園で起こる不可解な謎を、主人公の天ヶ瀬 美月(あまがせ　みづき)は、想いを寄せる"時計塔の博士"こと神代 学(かみしろ　まなぶ)先輩に持ちかける。彼の気を引くための、ほんの少しのきっかけのつもりだった。 論理で全てを解き明かそうとする博士と、彼に恋する美月の関係はどこへ向かうのか。二人の青春ミステリーが今、始まる。