平凡な青年・黒崎蓮は、ある夜、人には見えない「黒い影」に襲われる。 彼を救った謎の少女・リリア。 彼女との出会いをきっかけに、蓮は十三年前に起きた「黒い夜」と、自分自身の失われた過去を知ることになる。 なぜ黒影は蓮を狙うのか。 なぜリリアは蓮の過去を知っているのか。 そして、蓮の中に眠る「黒い力」の正体とは――。 過去の記憶と黒影の謎を追う中で、二人は世界の裏側に隠された真実へと迫っていく。