リコ、ロイ、ドット、ウルト、ナヴィ。 冒険を続ける5人の前に、ある日、一人の見知らぬトレーナーが現れた。 彼の名前は――ダイズ。 ポケモンレンジャーとして活動する彼は、リコたちの知らない世界からやって来たという。 冷静沈着で、ポケモンとの息もぴったり。 しかも、木の実さえあれば、どんな料理でも作ってしまうほど旅慣れた人物だった。 しかし、ダイズには誰にも話していない目的があった。 彼が探しているのは――幻のポケモン。 そして、特殊な「光の粒」。 なぜ彼は幻のポケモンを探しているのか。 なぜ、この世界へやって来たのか。 その謎が明らかになる前に、思いもよらない事件が起こる。 時空を越え、飛ばされた先は―― 別のポケモンの世界。 そこに待っているのは、見たことのないポケモン。 知らない人々。 異なる歴史。 そして、それぞれの世界で起こる事件。 リコたちは元の世界へ帰るため。 ダイズは自分の目的を果たすため。 それぞれの目的を胸に、6人とポケモンたちの長い旅が始まる。 これは、世界と世界を越えて紡がれる、新たなポケモンたちの冒険譚。