中学時代に「ジェノサイド斎藤」と「ダークマター菜穂子」を名乗っていた幼馴染の二人。 高校では普通の生活を送りたい斎藤と、今も厨二病を貫く黒石は、何かといがみ合いながらも少しずつ距離を縮めていく。 過去を黒歴史として捨てたい斎藤と、過去を大切な思い出として受け入れる菜穂子。 二人の関係は、やがて「ただの幼馴染」から少しずつ変わり始める――。