人類の頭上に「残り寿命の秒読み」が出現した世界。それは特権階級がナノマシンで命を支配する「処刑予定時刻」だった。余命3ヶ月を宣告され絶望していた青年・蓮は、不老不死の数字を持つ少女・ハルと出会う。世界の真実を知った二人は、管理システムを破壊するため、命懸けの逃走劇の末に中央サーバーへ突入。運命の午前零時、自らの手で未来を切り拓くため、世界を欺く最後の叛逆へ挑む。