《エンペラーオンライン》のクリア後、雨宮涼真の元に届く一通の黒い封筒。 それは新たなゲーム《ラプラス・アイ》への招待状だった。 宣戦布告とも取れる、かつての戦友たちへの攻撃により取り戻したはずの平穏が崩れようとすることを防ぐため、再び彼らの闘いが始まる。