ある日始まった奇病は多くの命を奪った。 感染者の胸の中に刻まれた、時計の音は次第に大きくなる。 それはまるでーー時限爆弾だった。 『ーー愛してください』 その呟きは死神の言葉。 多くの命が奪われて、人類が文明を築きながら生活できる空間は限られていた。 第五隔離区セクターβ、そこで検疫官として働く神祈斗賀見。 彼は消えないチクタクという都市伝説を耳にする。 彼が『消えないチクタク』に触れた時、運命という"秒針"が加速する。