長崎の原爆で破壊された浦上天主堂。 かつて東洋一美しいと言われた無原罪のマリア像はその姿を失い、その場に集っていた信徒は全員死亡。建物は甚大な被害を受けたものの外壁の一部は残されていた。 突如、その遺構の撤去が決定される。 保護を求めていたシスターは、かつて保護に協力的であった市長の取り壊し決定に必死の抗議をするが…。 長崎の「原爆ドーム」と成りえた浦上天主堂取り壊し・再建。 そこに見え隠れする「失われたマリア像」と、彼女に様々な想いを抱く人々の物語