西暦何年のペネトレイト軍とのリバイブ軍の一触即発の戦況の中、ペネトレイト軍はこの戦いの中でごく一部の人間しか知らない新たな機体MOを秘密裏に開発させていた。 特殊第009部隊の数機で運搬にあたっていた。だがしかし、リバイブ軍の猛攻撃に次々に機体は大破、辛うじて生き残った一機とコンテナは宙域を彷徨い後にリバイブ軍の艦隊に回収されてしまう。 ペネトレイト軍の兵である青髪の青年はペネトレイト軍とリバイブ軍との論争に何を見出したのかーーー…。