中学二年生の早川真琴（マコト）は、終業式の日に不思議な生き物に出会う。動物好きで好奇心旺盛なマコトは、思わずその生き物を追いかけて、自宅の隣の古びた空き家にたどり着く。そこにはいつの間にか、たくさんの本や観葉植物、骨格標本がひしめく「研究室」がつくられて、一風変わった「博士」が住み着いていた……。博士とマコトの、たった一度の夏休みの、忘れられない小さな冒険譚。