ヒトと竜が覇権を争う惑星、エストレラ。 “アタランテ”と呼ばれる人々は、竜の骨から造られた機械を駆り、命を賭して竜を狩ることを生まれながらにして宿命とされていた。 そんなアタランテの一人であるレグナは狩りの最中、”禁足地”へと迷い込む。 そこに待ち受けていたのはヒトと竜、全ての始まりを司る”始原の塔”と、マナと名乗る不思議な少女だった。