二十九歳の会社員の神谷大和（かみや やまと）は、フルダイブ宇宙戦略ゲームでサーバーランキング一位を誇る艦隊司令官だった。ある日、ゲーム中に寝落ちして目を覚ますと、そこは未知の宙域を漂流する旗艦の司令室。乗員たちは彼を「レオニス・ガイラディア閣下」本人として接し、本物の艦隊司令官として判断を求めてくる。ゲームで培った戦略だけを頼りに、未知の世界で艦隊司令官として生き抜いていくことになる。