妖怪は滅び、その血だけが人に受け継がれた。 人知を超えた力「妖式」を操る特異者たちを管理する国家機関・特異調査機関。 隊長・二鷺唯と相棒パンプキンマンは、特異者による事件を追う中で、日本を揺るがす陰謀と、妖怪の起源へと迫っていく。