妖怪因子――それは、人に妖の力を宿す、正体不明の因子。 河童、天狗、そして人魚。彼らと同じ力を持つ青年・草薙陸は、里の"事件屋"として、因子にまつわる怪異を追っていた。 しかしある事件をきっかけに、陸は、自分と同じ顔を持つ青年と出会う。彼の名は、三輪玲。二人の間には、千年前の因縁が眠っていた――。 オカルトから始まる物語は、やがて隠された真実へと辿り着く。