人の感情が魔力になる異世界。 喜び、怒り、嫉妬、憧れ、恐怖。 人々の強すぎる想いは現実を書き換え、怪物（404コード）となって世界を蝕んでいた。 その脅威に立ち向かう魔法士を育成するための学園、王立魔法学園（アーカイブ）。 そこへ入学した天城シオンは、最低評価の能力【疑義（クエスチョン）】を持つ落ちこぼれだった。彼の力は、情報や現象に潜む「矛盾」を見るだけ。戦うことも、人を救うこともできない欠陥能力。 ……そう思われていた。 しかし入学式の日、シオンは全校生徒の前で告げる。 「この学園には嘘がある」と。 そんな彼の前に現れたのは、誰からも愛される完璧な少女、星乃ミライ。 人の感情を操る力を持つ彼女は、シオンとは正反対の存在だった。 疑う少年と、嫌われることを恐れる少女。 二人は廃止寸前の研究ゼミ、【境界研究ゼミ】を再建することになる。 そこに集まるのは、情報を切り取る少女。怒りを力に変える少年。存在を消してしまう少女。注目を操る少年。誰もが欠点を抱えた問題児たち。 彼らが向き合うのは、ただの怪物ではない。 それは、人間の中にある「本当は誰かに分かってほしかった」という感情だった。 嘘だらけの世界で、少年は問い続ける。正しいことだけで、人は救えるのか。 そしていつか気付く。疑うことと、信じないことは違うのだと。