文泉元年、軍人によるクーデターが勃発し、優れた子どもたちを選抜する新教育制度が施行された世界。 地域貢献部に所属する朝霧紅葉は仲間たちを救うべく、奇策を弄することで危機を脱する。しかし本人の意図に反し、二階級特進と銀の大樹賞受賞という異例の処置が取られてしまうのだった。 一方、技術部に所属する千正朱熹は新進気鋭の部員である。実質部内のNo.2である次長へと昇格し、執行部会議へと参加する。だが、そこには本当の学園の姿があった。 数奇な運命に翻弄されながらも、彼女らは交じり合うことなく自分の道を選び、進んでいく。