宇宙船《リヒト・スヴィエート号》の統括人工知能“ネライダ”と船長シレーヌは、ある計画のために光速に近い速度で宇宙を航行していた。地球に残った幼馴染のルフトは、遠く離れたシレーヌを通信越しに見守り続けていた。だが、航行が進むにつれ、《リヒト・スヴィエート号》は幾多のトラブルに見舞われる。そしてそれは、やがて太陽系を揺るがしかねない大事件へと発展し、様々な人々を突き動かすことになる。