終焉戦争から三年。 世界は生き残った。 だが、 海は変わってしまった。 各地で発生する“深海化現象”。 海中に現れる未知の構造体。 そして、 人間の身体に発現し始めた新たな適合因子――。 かつて世界を救い、 終焉存在を打ち破った男、 榊悠真の名は、 今や伝説となっていた。 しかし。 世界の海底では、 静かに“新しい原初”が目覚め始めていた。 これは、 終焉後の世界で始まる、 新たな進化と継承の物語。