昭和二十年八月、俺こと佐野文由は恋人の名を叫び、敵空母に零戦で特攻を仕掛けた。 しかし、突然眼下には大海原だけが広がり、何とか洋上に不時着した俺は、海衛隊の護衛艦に救助される。 艦内で、恋人に瓜二つの渡辺澪璃から、俺は令和元年にタイムトラベルしてきたと告げられた。 更に、恋人は俺の帰還を信じ、独り待ち続けている事を知る。 令和の日本では未曾有の災禍が起きていて、原因は災厄な怪異の封印が解けたからだと話をされる。 それに対抗できるのは、陰陽師の末裔の俺だけが継承している、式神だけだという。 そこで、澪璃と密約をした俺は、怪異に立ち向かうことを決意する。 この令和の夏空の下で君と過ごす為に。