ゲートと呼ばれる怪物を生み出す扉が開かれて200年。 【ペルソナ】と呼ばれる能力を使い、人類はゲートから現れる化け物たちとの闘争に明け暮れる日々。 そんな物騒な世界でペルソナを持たずに生まれてきたことにより、周囲から浮いてしまった存在の主人公は無能力という理由で理不尽な目に遭う。 あることがきっかけでペルソナを得た主人公。 今まで理不尽を敷いてきた、クラスメイト、ゲート、世界に反逆する。