父を殺した巨大企業ジェネシス。３秒の予知能力を持つ天才ハッカー・ケイは、相棒レイジと共に仮想世界NEXUSへ潜入する。敵は全人類の意識をサーバーに繋ぎ止める「グランド・オーバーライド」を目論む敵に挑み、裁きを受けさせる。