リュウトとナノハは中学生になった仲良しな男女。
しかし、リュウトとナノハは肉体が別々にあるだけで、中身はリュウトでもありナノハでもある。

リュウトとナノハは別クラスになり、違う環境下で別々の人間として今まで通り、お互いに違う友達を作っていた。

ある日、リュウトはサユキという女の子に恋をし、告白するが振られてしまう。

リュウトの告白から数時間後、ナノハは仲の良いエリハからサユキの愚痴を聞かされる...