ある日突然、未知の生命体であるユニヴァが現れ蹂躙していく。それに人類は対抗しようとシリアルドが結成されここから人類vsユニヴァの戦いが幕を開けた。 そんな中で新人隊員のシャロは、未知の生命体《ユニヴァ》と戦う組織シリアルドに配属される。正確無比な戦果を上げながらも、彼はどのツールにも選ばれず、その理由も語られない。英雄と呼ばれ始めた彼の前に、「世界の側」に立つ兄が現れたとき、シャロは選択を迫られる。