日浦悠人は、娘のように可愛がっていた金魚を亡くした日から、世界が灰色に見えるようになっていた。 大学卒業後、彼は神社の神主として静かな日々を送っていたが、ある日、境内を掃除している最中に一人の少女が現れる。 「ここで巫女として働かせてほしい」——そう願い出たのは、どこか現実離れした雰囲気をまとった謎の美少女だった。 その出会いをきっかけに、止まっていた悠人の日常は、ゆっくりと、しかし確実に変わり始めていく——。