高校三年生の春、やる気のない遅刻常習犯
藤林龍太の前に、一人の美少女転校生が現れる。
九条瑠璃と名乗る彼女との出会いを境に、龍太の退屈な日常は一変。裏で暗躍する組織の影や不可解な事件に巻き込まれながら、龍太は彼女と共に過酷な運命へと立ち向かっていく。
共に過ごす時間の中で少しずつ絆を深め、成長していく二人。
しかし、その穏やかな日々の裏には、決して逃れられない宿命が隠されていた。
彼女の正体はーー。