宇宙ステーションで働く新人作業員・永野美柚は、同期の喜多治那奈と共に初の外部点検任務へ向かう。 作業中、二人は宇宙空間に浮かぶ謎の緑色の物体を発見する。それは人類が確認したことのない未知の存在だった。 未確認物体の接近により、宇宙ステーションは緊急事態に突入する。 そして、美柚たちは人類初となる“未知との遭遇”へ巻き込まれていく――。