記憶を失った少年・水瀬杜遥は、ある日病室で目を覚ます。 そこで妹と祖母を名乗る人物と出会い、彼は田舎で暮らすことになる。 しかし、自分が何者なのかも分からないまま過ごす日々は、どこか空虚だった。 やりたいことも見つからず、ただ過ぎていくだけの日常を変えようと、杜遥はふらりと散歩へ出かける。 その途中、彼は不思議な雰囲気を纏う少女・朝霧燦と出会った。 そして彼女から、「五年に一度、人が死ぬ」と噂される神社の話を聞かされるのだった――。