転校生・星野朔夜は、父親の仕事の都合で幼い頃に住んでいた海辺の町に戻ってくる。廃墟と化した天文台で彼女が出会ったのは、ひとりで観測を続ける部長・月城柑橘——「星の色が見える」と語る謎めいた少女だった。廃部寸前の天文部を再建するため、二人は「一緒に見たい星象を百個集める」という約束を交わす。移りゆく四季の中で、柑橘が秘めた能力の真実が次第に明らかになり、同時に朔夜は、自分の転校の裏に隠されたある事情に気づき始める……。