少女を殺せと命じられた記憶喪失の青年、藤本旭は葛藤の末、世界に反旗を翻すことを決意する。 だが、それは同時に世界を裏から守る星刻者たちと戦うことでもあった。 大地震で荒廃した地区――エリアZで旭は謎の装置、モーフィングホルダーを手に入れる。また、この世界の秘密を抱える星刻者たちと遭遇する。 このままでは機密事項保持のために処刑される予定だったが、唯一の救済措置を告げられる。 それは西大條陽香里を暗殺することであった。 しかし、旭は彼女との交流で失った記憶を思い出す。そして彼女を守ることを決心する。 旭は自分の信念を貫き通すために、たった一人で剣をふるう！