異常気象によって地上が滅び、人類は地下に追いやられた未来――。 貧民街で生きる少年アキルは、危険な輸送グライダーのパイロットとして日銭を稼いでいた。 ある日、謎の戦闘機に襲われた彼を救ったのは、 空に浮かぶ楽園から現れたロボット兵器と、そのパイロットの少女・フューシャ。 ――「あなた、私の運命の人だと思うの」 出会った瞬間、彼女はアキルに一目惚れ。 しかし彼女の正体は、浮島を統治する司政官の娘にして、 『人間ではない存在』として戦うためだけに育てられた少女だった。 疑念を抱きつつも、彼女に近づくため浮島へ潜入するアキル。 やがて彼は知る―― 浮島の真の姿と、 フューシャは、『兵器』でしかないことを。 「それでも、あなたが好き」 禁じられた接触の中、惹かれ合っていく二人。 だが彼女の想いは、感情を持つことを許されない『兵器』にとって致命的な負荷となり―― やがて世界を揺るがす選択を迫られる。 これは、すべてをあきらめた少年と、『恋をしてはいけない少女』が、 出会ってしまった物語。