太古、地球に“神”が降りた。 神の与えた力に耐えた者は、自然の力を操る魔術師と語られた。 魔素と呼ばれる謎のエネルギーに満ちた地球。 世界各国では魔骸と呼ばれる怪物が人々を襲い、魔術師は魔骸を討伐し人々を守ることを生業とする。 日本で日常を過ごしていた小鳥遊天は町を訪れた魔術師、九条雪に弟子入りし、魔術の世界に入門する。 だが彼はまだ知らない。 人類を“進化させる”ために世界を敵に回した最強の魔術師の存在を。 魔術師たちの思惑が交錯する中、少年はやがて選択を迫られる 進化は祝福か、呪いか。 少年の選択が、世界を揺るがす。