孤児院に身を寄せる12歳の双子の男女、リュウトとサクラ。 ある時サクラは高熱で生死の境を彷徨う。 2人のいる孤児院は病人に冷たかった。 治療も受けさせてもらえず、リュウトは決意する。 なんとしても金を作り、薬を用意することを。 リュウトは旅人に狙いを定め、金を盗もうする。 それがリュウトとサクラを魔法薬師の道へと誘うことになる。 やがてリュウトとサクラは、自分たちが生まれた意味まで繋がる運命に翻弄されていく。