人々を守護していた始祖はもういない。戦乱の時代は終わりを告げ、新たな時代がやってきた。そんな時代の中で、『始祖返り』という異質な存在が現れた。その者たちはかつて失われたはずの始祖の血を継ぎ、適合し、始祖の力を扱う。だが、人々は異質を嫌う。追放し、排除し、人々は平穏を保とうとする。そんな中でも、希望を失わず、同じ境遇の仲間を探し、助けようとする少年がいた。これは少年が『始祖返り』を探し旅に出る物語。