聴覚障害の女子校生、草壁琴音は幼い頃からある声がいつも聞こえていた。日常生活では聞こえるはずのない声であるが、彼女には脳内に直接、人の声が聞こえておりいつも琴音を支える形で励ましてくれていた。琴音はその声の主を『不思議ちゃん』と名づけて困った時、相談したい時、悲しい時なんかは傍に居てくれる良き友達の関係になった。 聴覚障害の琴音と正体不明の謎の声、不思議ちゃんが巡りあった時、物語は始まる――