銀河より飛来したエネルギー源「総和体（トータリティ）」をめぐり、ジャスティス・リーグとレックス・ルーサー率いるヴィラン軍団リージョン・オブ・ドゥームの戦いは続いていた。 ジャスティス・リーグはレックス・ルーサーの企みから多元宇宙を救う鍵を探しに、宇宙の彼方「第六の次元」へと向かう。 一方、スーパーマンは光のない宇宙に閉じ込められ、危機に瀕していた。はたしてジャスティス・リーグとスーパーマンはこの危機を乗り越え、戦いに勝利することができるのか！？