高校一年の夏休み。 友達もできず、退屈な毎日を過ごしていた湊音は、久しぶりに帰ってきた幼なじみの美海と再会する。 やることのない夏を持て余していた湊音は、美海のお父さんの仕事を手伝うことになるが､､､ 小さな船で海に出て、クジラの声を探す日々。 しかし調査を続けるうちに、三人はある事実に気づく。 この海は今、静かに変わり始めている――。