妖（あやかし）とは、遥か昔より人に害を為す存在。 それらを討つ退魔師は、妖との戦いの記録を「妖伝」（ようでん）として後世に残してきた。 だが、その真意を解き明かそうと旅に出た者で、生きて帰った者はいない。 時は明治。 屋敷で働きながら暮らす少女、葛城朱鞠（かつらぎしゅま）は、夜になると弓を手に妖を討つ退魔師だった。 彼女はやがて、命を落とした退魔師たちが残した記録、「妖伝」の真実を追う旅へと踏み出す。