「お前の整備は時間がかかるんだよ！」 Sランクパーティーの仲間である、幼馴染のレオンにそう告げられ、整備士アルトはタダ働きをさせられていた日々を終えた。 彼が施していたのは、単なる手入れではない。聖剣の崩壊を防ぐ、精密極まる神の調整だった。 追放されたアルトは、禁忌の地でボロボロの少女型アンドロイド・アイリスを拾う。