平成半ばに起きた“大異変”。 それ以来、世界には光の粒子――《エーテル》が雪のように降り続いている。 地上は危険地帯となり、人々は地下鉄跡や地下街を拠点に生き延びていた。 エーテルに侵食された建物は“ダンジョン”へと変質し、一定期間ごとに再生成される。 人々はそこから食料や電力を回収し、辛うじて文明を維持していた。 大学卒業を目前に将来を決められないまま駅のホームに立っていた東雲陸は、 突然の光に包まれ、この崩壊世界へと転移する。 肉体強化の力を得た陸は危険視され地下街に拘束されるが、 真面目で帰還を強く望む少女・一ノ瀬栞、 そしてダンジョン内で“なぜか教祖扱い”されていた魔法特化の男・鳴海透と再会する。 力で突破する陸。 理性で止める栞。 ノリで生き延びる透。 三人は再生成され続けるダンジョンへと潜り、 エーテルに満ちた世界の深層へと踏み込んでいく。 帰るために。 生きるために。 そして、この世界の真実に辿り着くために。