「作れない」劣等感が、世界を救う力に変わる。 突如空から飛来する機械生命体「ギアロイド」の脅威に晒された世界。プラモデル作りが苦手な少女・そらは、凄腕ビルダーだった亡き父の面影を追い、失敗を繰り返しながらも独りキットに向き合っていた。 そんなある日、彼女の前に現れたのは、手のひらサイズの生きた意志——ギアスピリットの「アルファ」。父の相棒だったという彼との出会いが、そらの運命を劇的に変える。 「お前の意志が、俺の動力源だ！」 不器用な手つきで組み上げた渾身の一体が、眩い光を放ち巨大な守護神へとビルド・オン！ 未熟な新人ビルダーと誇り高き魂がシンクロする時、絶望の空を切り裂く反撃の火蓋が切って落とされる。