「人には誰にも秘密がある」。その秘密を知りたい高校生の「タクミ」は担任の「海先生」と、生徒達の秘密の悩みを解決する「秘密部」を創設する──だがクラスメイトの女子「ソラ」から難解な秘密の依頼が！そして秘密部を創設したタクミの本当の目的は！？数々の秘密の依頼が舞い降りる──果たして秘密部は解決できるのか！？