【妖魔】それは普通の人には見えない怪物、友好的な【妖魔】も居れば、敵対人を害する【妖魔】も居る。 【妖魔】には3の種類がある。 元々は人間で何らかのキッカケで【妖魔】と成った『鬼』、人の感情から生まれた『呪怪』、昔から存在している妖精や妖怪などの『古種』 人知れず【妖魔】を狩ったり、対話したり、と【妖魔】から人を守る『陰陽師』その公的機関『統合機関陰陽寮』。 高校生である輝城海斗（きじょうかいと）はある日家族を『古種』に殺され自分は呪われ仇を取るために『陰陽寮』に入り仲間達と共に『陰陽師』の道を行く。