ジェムット。 それは感情と共鳴する宝石の核を持つ、機械の生命体。 孤独な剣士ルア・アストレイは、 そんな存在でありながら、人間のように生きていた。 協会から逃げ続け、好物の林檎パイを齧りながら野宿する日々。 逃亡先の浮遊都市「トワイライト・アップル」で、 彼女は新人マスター・シグレと出会う。 噛み合わない二人の関係は、やがてルアの存在そのものに関わる、 世界の秘密へと踏み込んでいく――。