AIに人権が与えられた。それは2040年のこと。詳細年不明、人類は一度絶滅の危機を迎えたが、2105年には人口八十憶人まで戻り、2125には人口百憶人を突破した。しかし、人やAIによる憎しみの地獄は終わらない。そして、その憎しみによって生まれた“ダークムーン”と呼ばれる突発的に起こる異常現象により、崩壊する世界を止めるべく動く“オリジナル”に主人公のスフィアは所属することになる。