救世主を目指す何の変哲もない少年、無涅 槃（むね めぐる）は2044年の4月4日に救世主を育成する学校である国立人機西教育学校に入学する。 そこで、先輩である明時 無無（あきとき なな）と出会い、彼の運命は終着へ動き出す。