防衛省が新規採用した戦略防衛プログラム『ATHENE』。その名の通り国の守護神になるはずだった。 最新鋭空母『ポセイドン』の就航式直前、『ATHENE』に異常が発生！ 『ポセイドン』は就航式を待たずに緊急任務に着くこととなった。 『ATHENE』に搭載されたＡＩは驚異的早さで“学習”し、世界を恐怖に陥れる。 世界の運命は『ポセイドン』の乗員と４人のエースパイロットに託された。