幕末・長崎。 開国の波に揺れる港町で、天草四郎の血を引く青年・天草祐一は、自身の中に眠る“魔導の力”に目覚める。 坂本龍馬率いる亀山社中に身を置いた祐一は、日本を守るため、幕府の闇組織「魔導局」と戦うことになる。 女医・楠本イネ、異国のシスター・マリアとの出会い。 そして、迫り来る幕府の陰謀――。 歴史と幻想が交差する、幕末魔導ファンタジー開幕。