自然と花を愛する少年、亀鶴 美知留。 高校では園芸部に入り、穏やかな学園生活を送るはずだった。 だが現実は、二人の姉の命令で女装し、女子校へ入学という地獄のスタート。 逆らえない性格のせいで、今日も運命に流されるまま登校する。 そんな彼に目をつけたのは、学園の有名人、市二神マキナ。 「ねぇ、あなた？　WE部に入りなさい」 またしても命令され、入部することになってしまう。 しかもその部活には、とんでもない活動内容が隠されていた。 「さぁ、今日も世界を滅ぼすわよ！」 「……はい？」 美知留の平穏な園芸ライフは、今日も遠ざかっていく――