昔、世界級魔法の魔女・みゆきは、迫害される人々を守る王国を築いたが、疑念に傷つき、世界を争いのない「人形の箱庭」に変えた。数千年後、記憶を封印されたみゆきは日本で青年・ゆうとして転生。小説を書きながら過去を思い出し、最後の魔法で少女・神宮寺結衣を生む。九尾の狐の夫と共に、心の傷を癒やし、真の幸せと世界の救いを求める。